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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lne | ||||||
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タイトル | Neurotensin 40 structures in water pH 5.5 298 K. NMR data & structures | ||||||
要素 | Neurotensin | ||||||
キーワード | NEUROPEPTIDE / Neurotensin(NT) / recombinant technology | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 neuropeptide receptor binding / neuropeptide hormone activity / neuropeptide signaling pathway / axon terminus / transport vesicle / blood vessel diameter maintenance / Peptide ligand-binding receptors / positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity / G alpha (q) signalling events / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction ...neuropeptide receptor binding / neuropeptide hormone activity / neuropeptide signaling pathway / axon terminus / transport vesicle / blood vessel diameter maintenance / Peptide ligand-binding receptors / positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity / G alpha (q) signalling events / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / receptor ligand activity / negative regulation of gene expression / intracellular membrane-bounded organelle / positive regulation of gene expression / signal transduction / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
データ登録者 | Mukhopadhyay, C. / Khatun, U. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biophys.Chem. / 年: 2012 タイトル: Modulation of the neurotensin solution structure in the presence of ganglioside GM1 bicelle. 著者: Khatun, U.L. / Goswami, S.K. / Mukhopadhyay, C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2lne.cif.gz | 172.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2lne.ent.gz | 122 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2lne.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2lne_validation.pdf.gz | 512 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2lne_full_validation.pdf.gz | 751.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2lne_validation.xml.gz | 21.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2lne_validation.cif.gz | 25.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ln/2lne ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ln/2lne | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1693.964 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: NTS / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P30990 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: 2D 1H-1H TOCSY, 2D 1H-1H ROESY, 2D DQF-COSY |
-試料調製
詳細 | 内容: 4.5 mM Neurotensin-1, 90% H2O/10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 4.5 mM / 構成要素: Neurotensin-1 |
試料状態 | イオン強度: 4.5 / pH: 5.5 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 40 / 代表コンフォーマー: 1 |