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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ln8 | ||||||
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タイトル | The solution structure of theromacin | ||||||
![]() | Theromacin | ||||||
![]() | ANTIMICROBIAL PROTEIN / antimicrobial peptide | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
![]() | Jung, S. / Soennichsen, F.D. / Hung, C.-W. / Tholey, A. / Boidin-Wichlacz, C. / Hausgen, W. / Gelhaus, C. / Desel, C. / Podschun, R. / Watzig, V. ...Jung, S. / Soennichsen, F.D. / Hung, C.-W. / Tholey, A. / Boidin-Wichlacz, C. / Hausgen, W. / Gelhaus, C. / Desel, C. / Podschun, R. / Watzig, V. / Tasiemski, A. / Leippe, M. / Groetzinger, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Macin family of antimicrobial proteins combines antimicrobial and nerve repair activities. 著者: Jung, S. / Sonnichsen, F.D. / Hung, C.W. / Tholey, A. / Boidin-Wichlacz, C. / Haeusgen, W. / Gelhaus, C. / Desel, C. / Podschun, R. / Waetzig, V. / Tasiemski, A. / Leippe, M. / Grotzinger, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 134.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 113.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 460.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 523.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 28.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8465.528 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR / 詳細: The solution structure of Thermomacin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 93% H2O/7% D2O / 溶媒系: 93% H2O/7% D2O |
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試料 | 濃度: 1 mM / 構成要素: entity-1 / Isotopic labeling: [U-99% 13C; U-99% 15N] |
試料状態 | イオン強度: 0.02 / pH: 7.4 / 圧: ambient / 温度: 300 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |