THE STARTING COMPONENT IS (2E,4R)-4-HYDROXYNON-2-ENAL AND THE FINAL PRODUCT IS REPRESENTED BY (4S)- ...THE STARTING COMPONENT IS (2E,4R)-4-HYDROXYNON-2-ENAL AND THE FINAL PRODUCT IS REPRESENTED BY (4S)-NONANE-1,4-DIOL.
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
タイプ: 2D 1H-1H NOESY
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試料調製
詳細
内容: 1 mM DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*GP*CP*GP*AP*GP*TP*CP*C)-3'), 1 mM DNA (5'-D(*GP*GP*AP*CP*TP*CP*GP*CP*TP*AP*GP*C)-3'), 1 mM (2E,4R)-4-HYDROXYNON-2-ENAL, 100% D2O 溶媒系: 100% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Solution-ID
1mM
DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*GP*CP*GP*AP*GP*TP*CP*C)-3')-1
1
1mM
DNA (5'-D(*GP*GP*AP*CP*TP*CP*GP*CP*TP*AP*GP*C)-3')-2
1
1mM
(2E,4R)-4-HYDROXYNON-2-ENAL-3
1
試料状態
イオン強度: 100 / pH: 7.3 / 圧: ambient / 温度: 298 K
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NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
500
1
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
800
2
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解析
NMR software
名称: Amber / バージョン: 10 開発者: Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, and Kollm 分類: 精密化
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1
NMR constraints
NOE constraints total: 369
代表構造
選択基準: closest to the average
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: back calculated data agree with experimental NOESY spectrum 計算したコンフォーマーの数: 10 / 登録したコンフォーマーの数: 1