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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lb4 | ||||||
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タイトル | DNA / RNA Hybrid containing a central stereo specific Sp borano phosphate linkage | ||||||
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![]() | DNA/RNA / nucleic acid heteroduplex / RNase H1 activity / DNA-RNA complex | ||||||
機能・相同性 | DNA / RNA![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
Model details | structure with lowest restraint violations, model 1 | ||||||
![]() | Johnson, C.N. / Spring, A.M. / Shaw, B.R. / Germann, M.W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Basis of the RNase H1 Activity on Stereo Regular Borano Phosphonate DNA/RNA Hybrids. 著者: Johnson, C.N. / Spring, A.M. / Sergueev, D. / Shaw, B.R. / Germann, M.W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 22.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 12.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 334.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 339.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 2.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2larC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 2743.637 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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#2: RNA鎖 | 分子量: 2854.782 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 50 / pH: 7.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: structure with lowest restraint violations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structure with lowest restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 10 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |