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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lae | ||||||
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タイトル | NMR solution structure of the C-terminal domain of the E. coli lipoprotein BamC | ||||||
要素 | Lipoprotein 34リポタンパク質 | ||||||
キーワード | MEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) / BETA-BARREL ASSEMBLY MACHINERY / BAM / BAMC | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Bam protein complex / Gram-negative-bacterium-type cell outer membrane assembly / protein insertion into membrane / 細胞膜 / 生体膜 / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
データ登録者 | Pardi, A. / Warner, L. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2011 タイトル: Structure of the BamC Two-Domain Protein Obtained by Rosetta with a Limited NMR Data Set. 著者: Warner, L.R. / Varga, K. / Lange, O.F. / Baker, S.L. / Baker, D. / Sousa, M.C. / Pardi, A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2lae.cif.gz | 322.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2lae.ent.gz | 259.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2lae.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/la/2lae ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/la/2lae | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 26998.979 Da / 分子数: 1 / 断片: sequence database residues 229-344 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: K12 / 遺伝子: nlpB, dapX, b2477, JW2462 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A903 |
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構成要素の詳細 | THE ENTIRE PROTEIN SEQUENCE IN PROVIDED IN THE SEQRES SECTION OF THE PDB FILE. HOWEVER, THE ...THE ENTIRE PROTEIN SEQUENCE IN PROVIDED IN THE SEQRES SECTION OF THE PDB FILE. HOWEVER, THE ENSEMBLES WERE CALCULATED |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.2 / pH: 6.6 / 圧: ambient / 温度: 303 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 9 |