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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l9x | ||||||
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タイトル | Trn- peptide of the two-component bacteriocin Thuricin CD | ||||||
要素 | Uncharacterized protein | ||||||
キーワード | ANTIMICROBIAL PROTEIN / thioether bridges / helical loops / crosslinked / post-translationally modified | ||||||
機能・相同性 | Uncharacterized protein 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Bacillus cereus 95/8201 (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
データ登録者 | Sit, C.S. / Mckay, R.T. / Hill, C. / Ross, R.P. / Vederas, J.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2011 タイトル: The 3D structure of thuricin CD, a two-component bacteriocin with cysteine sulfur to alpha-carbon cross-links. 著者: Sit, C.S. / McKay, R.T. / Hill, C. / Ross, R.P. / Vederas, J.C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2l9x.cif.gz | 169.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2l9x.ent.gz | 126.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2l9x.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2l9x_validation.pdf.gz | 394.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2l9x_full_validation.pdf.gz | 447.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2l9x_validation.xml.gz | 10.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2l9x_validation.cif.gz | 17 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l9/2l9x ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l9/2l9x | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2770.210 Da / 分子数: 1 / 断片: sequence database residues 18-47 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bacillus cereus 95/8201 (バクテリア) / 株: DPC 6431 / 参照: UniProt: C2TQ80 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Trna, 100 uM DSS, CD3OH 溶媒系: CD3OH | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: all calculated structures submitted 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |