+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l8e | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Solution NMR structure of FCS domain of Human Polyhomeotic Homolog 1 (HPH1) | ||||||
![]() | Polyhomeotic-like protein 1 | ||||||
![]() | DNA BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() : / PRC1 complex / multicellular organism development / PcG protein complex / negative regulation of G0 to G1 transition / SUMOylation of DNA methylation proteins / SUMOylation of RNA binding proteins / RUNX1 interacts with co-factors whose precise effect on RUNX1 targets is not known / Transcriptional Regulation by E2F6 / SUMOylation of DNA damage response and repair proteins ...: / PRC1 complex / multicellular organism development / PcG protein complex / negative regulation of G0 to G1 transition / SUMOylation of DNA methylation proteins / SUMOylation of RNA binding proteins / RUNX1 interacts with co-factors whose precise effect on RUNX1 targets is not known / Transcriptional Regulation by E2F6 / SUMOylation of DNA damage response and repair proteins / SUMOylation of chromatin organization proteins / SUMOylation of transcription cofactors / Regulation of PTEN gene transcription / histone binding / Oxidative Stress Induced Senescence / negative regulation of DNA-templated transcription / chromatin binding / DNA binding / zinc ion binding / nucleoplasm / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / DGSA-distance geometry simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
![]() | Ilangovan, U. / Kim, C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: 1H, 15N and 13C assigned chemical shifts of FCS domain from human polyhomeotic homolog 1 著者: Wang, R. / Ilangovan, U. / Kim, C. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 333.9 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 279.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 398.6 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 511.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 29 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
---|---|
その他のデータベース |
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5490.305 Da / 分子数: 1 / 断片: FCS-type zinc finger domain residues 783-828 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
---|---|
#2: 化合物 | ChemComp-ZN / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-
試料調製
詳細 |
| ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
試料 |
| ||||||||||||||||
試料状態 | イオン強度: 0.050 / pH: 6.0 / 圧: ambient / 温度: 300 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
|
---|
-
解析
NMR software |
| |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: DGSA-distance geometry simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |