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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l73 | ||||||
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タイトル | Structure of the NOXO1b PX domain | ||||||
![]() | NADPH oxidase organizer 1 | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE REGULATOR / Cell membrane / PX domain | ||||||
機能・相同性 | ![]() superoxide-generating NADPH oxidase activator activity / regulation of respiratory burst / regulation of hydrogen peroxide metabolic process / NADPH oxidase complex / WNT5:FZD7-mediated leishmania damping / phosphatidylinositol-3-phosphate binding / superoxide metabolic process / RHO GTPases Activate NADPH Oxidases / extracellular matrix disassembly / phospholipid binding ...superoxide-generating NADPH oxidase activator activity / regulation of respiratory burst / regulation of hydrogen peroxide metabolic process / NADPH oxidase complex / WNT5:FZD7-mediated leishmania damping / phosphatidylinositol-3-phosphate binding / superoxide metabolic process / RHO GTPases Activate NADPH Oxidases / extracellular matrix disassembly / phospholipid binding / enzyme binding / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
![]() | Davis, N.Y. / McPhail, L.C. / Horita, D.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the NOXO1b PX domain 著者: Davis, N.Y. / McPhail, L.C. / Horita, D.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 637.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 532.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 356.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 523.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 58.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 79.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16603.188 Da / 分子数: 1 / 断片: PX Domain, residues 1-144 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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配列の詳細 | THE DEPOSITED SEQUENCE CORRESPOND |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 0.5mM [U-13C; U-15N; U-2H] protein; 90% H2O/10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 0.5 mM / 構成要素: entity-1 / Isotopic labeling: [U-13C; U-15N; U-2H] |
試料状態 | pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 293 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: all calculated structures submitted 計算したコンフォーマーの数: 14 / 登録したコンフォーマーの数: 14 / 代表コンフォーマー: 1 |