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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l63 | ||||||
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タイトル | NMR solution structure of GLP-2 in 2,2,2 trifluroethanol | ||||||
要素 | Glucagon-like peptide 2 | ||||||
キーワード | HORMONE (ホルモン) / GLP-2 (GLP-2) / GPCR (Gタンパク質共役受容体) / Docking / Small Bowel Syndrome | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 glucagon receptor binding / : / negative regulation of execution phase of apoptosis / feeding behavior / positive regulation of calcium ion import / cellular response to glucagon stimulus / positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus / regulation of insulin secretion / Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin / positive regulation of gluconeogenesis ...glucagon receptor binding / : / negative regulation of execution phase of apoptosis / feeding behavior / positive regulation of calcium ion import / cellular response to glucagon stimulus / positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus / regulation of insulin secretion / Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin / positive regulation of gluconeogenesis / protein kinase A signaling / response to activity / positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation / 糖新生 / adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway / Glucagon signaling in metabolic regulation / adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / hormone activity / Synthesis, secretion, and inactivation of Glucagon-like Peptide-1 (GLP-1) / Glucagon-type ligand receptors / Glucagon-like Peptide-1 (GLP1) regulates insulin secretion / positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation / glucose homeostasis / G alpha (s) signalling events / G alpha (q) signalling events / secretory granule lumen / positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade / G protein-coupled receptor signaling pathway / 小胞体 / signaling receptor binding / negative regulation of apoptotic process / extracellular space / extracellular region / identical protein binding / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
データ登録者 | Venneti, K.C. / Hewage, C.M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Febs Lett. / 年: 2011 タイトル: Conformational and molecular interaction studies of glucagon-like peptide-2 with its N-terminal extracellular receptor domain. 著者: Venneti, K.C. / Hewage, C.M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2l63.cif.gz | 106.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2l63.ent.gz | 86.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2l63.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l6/2l63 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/l6/2l63 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3769.136 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P01275 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 33 % TFE-1, trifluoroethanol/water / 溶媒系: trifluoroethanol/water |
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試料 | 濃度: 33 % / 構成要素: TFE-1 |
試料状態 | pH: 3.9 / 圧: ambient / 温度: 310 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
NMR software | 名称: CYANA / バージョン: 2 / 開発者: Guntert, Mumenthaler and Wuthrich / 分類: 精密化 |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 |
代表構造 | 選択基準: fewest violations |
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |