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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l0l | ||||||
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タイトル | DsbB2 peptide structure in 70% TFE | ||||||
![]() | Oxidoreductase that catalyzes reoxidation of DsbA protein disulfide isomerase I | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / DsbB / organic solvent / folding | ||||||
機能・相同性 | : ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
![]() | Hwang, S. / Hilty, C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Folding determinants of disulfide bond forming protein B explored by solution nuclear magnetic resonance spectroscopy. 著者: Hwang, S. / Hilty, C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 194.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 165.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 328.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 427.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 13.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2832.493 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP Residues 1-43 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: Synthetic peptide / 由来: (合成) ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1 mM [U-100% 2H] TFE, 1mM DsbB protein fragment, trifluoroethanol/water 溶媒系: trifluoroethanol/water | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 6.8 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |