0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Hypothetical protein asr4154 from Nostoc sp. PCC7120, 20 mM MES, 100 mM sodium chloride, 5 mM calcium chloride, 10 mM DTT, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O
90% H2O/10% D2O
2
0.82 mM [U-5% 13C; U-100% 15N] Hypothetical protein asr4154 from Nostoc sp. PCC7120, 20 mM MES, 100 mM sodium chloride, 5 mM calcium chloride, 10 mM DTT, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O
90% H2O/10% D2O
3
0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Hypothetical protein asr4154 from Nostoc sp. PCC7120, 20 mM MES, 100 mM sodium chloride, 5 mM calcium chloride, 10 mM DTT, 0.02 % sodium azide, 100% D2O
100% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
0.9mM
Hypothetical protein asr4154 from Nostoc sp. PCC7120-1
[U-100% 13C; U-100% 15N]
1
20mM
MES-2
1
100mM
sodium chloride-3
1
5mM
calcium chloride-4
1
10mM
DTT-5
1
0.02 %
sodium azide-6
1
0.82mM
Hypothetical protein asr4154 from Nostoc sp. PCC7120-7
[U-5% 13C; U-100% 15N]
2
20mM
MES-8
2
100mM
sodium chloride-9
2
5mM
calcium chloride-10
2
10mM
DTT-11
2
0.02 %
sodium azide-12
2
0.9mM
Hypothetical protein asr4154 from Nostoc sp. PCC7120-13
[U-100% 13C; U-100% 15N]
3
20mM
MES-14
3
100mM
sodium chloride-15
3
5mM
calcium chloride-16
3
10mM
DTT-17
3
0.02 %
sodium azide-18
3
試料状態
イオン強度: 0.2 / pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 293 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Varian INOVA
Varian
INOVA
600
1
Bruker AvanceIII
Bruker
AVANCEIII
850
2
Varian INOVA
Varian
INOVA
500
3
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
NMRPipe
2008
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
解析
VNMR
6.1C
Varian
collection
TopSpin
2.1.4
BrukerBiospin
collection
AutoStructure
2.2.1
Huang, Tejero, PowersandMontelione
データ解析
X-PLOR NIH
2.2
Schwieters, Kuszewski, TjandraandClore
構造決定
CNS
1.2
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
Sparky
3.113
Goddard
データ解析
PSVS
1.4
BhattacharyaandMontelione
精密化
AutoAssign
2.3
Zimmerman, Moseley, KulikowskiandMontelione
chemicalshiftassignment
PdbStat
5.1
(PdbStat)-Roberto Tejero and Gaetano T. Montelione
構造決定
PINE Server
1
Bahrami, A., Assadi, A., Markley, J. L. & Eghbalnia, H.
autoassignment
CYANA
2.1
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 / 詳細: CNS water
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 125 / 登録したコンフォーマーの数: 20