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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kw1 | ||||||
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タイトル | Solution structure of CTD | ||||||
要素 | Fas apoptotic inhibitory molecule 1 | ||||||
キーワード | APOPTOSIS / beta-sheets | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 positive regulation of neurogenesis / canonical NF-kappaB signal transduction / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors / apoptotic process / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 3 | ||||||
データ登録者 | Ma, S. / Zheng, X. / Jin, C. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Solution structure of CTD 著者: Ma, S. / Zheng, X. / Jin, C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2kw1.cif.gz | 540.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2kw1.ent.gz | 455.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2kw1.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2kw1_validation.pdf.gz | 340 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2kw1_full_validation.pdf.gz | 426.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2kw1_validation.xml.gz | 24.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2kw1_validation.cif.gz | 43.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kw/2kw1 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kw/2kw1 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10079.250 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 91-179 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q9NVQ4 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 10mM HEPES; 50mM sodium chloride; 5mM DTT; 10% D2O; 0.01% DSS; 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | pH: 7.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software | 名称: Amber 開発者: Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, and Kollm 分類: 精密化 |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 |
代表構造 | 選択基準: lowest energy |
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 3 |