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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kp5 | ||||||
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タイトル | NMR structure of Hahellin, a beta-gamma crystallin | ||||||
要素 | Putative uncharacterized protein | ||||||
キーワード | CALCIUM-BINDING PROTEIN (カルシウム結合タンパク質) / beta-gamma crystallin / bacterial (細菌) / UNKNOWN FUNCTION | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 クリスタリン / Gamma-B Crystallin; domain 1 / Beta/Gamma crystallin / Crystallins beta and gamma 'Greek key' motif profile. / Beta/gamma crystallin / Gamma-crystallin-like / Coagulation factors 5/8 type C domain (FA58C) profile. / F5/8 type C domain / Coagulation factor 5/8 C-terminal domain / Galactose-binding-like domain superfamily ...クリスタリン / Gamma-B Crystallin; domain 1 / Beta/Gamma crystallin / Crystallins beta and gamma 'Greek key' motif profile. / Beta/gamma crystallin / Gamma-crystallin-like / Coagulation factors 5/8 type C domain (FA58C) profile. / F5/8 type C domain / Coagulation factor 5/8 C-terminal domain / Galactose-binding-like domain superfamily / サンドイッチ / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 | ||||||
生物種 | Hahella chejuensis (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing, torsion angle dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
データ登録者 | Srivastava, A.K. / Sharma, Y. / Chary, K.V. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: NMR structure of Hahellin, a beta-gamma crystallin 著者: Srivastava, A.K. / Chary, K.V. / Sharma, Y. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2kp5.cif.gz | 624.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2kp5.ent.gz | 532 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2kp5.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kp/2kp5 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kp/2kp5 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10262.287 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 162-252 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Hahella chejuensis (バクテリア) / 株: KCTC 2396 / 遺伝子: HCH_03072 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q2SHN6 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | pH: 6.7 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 800 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing, torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 1 |