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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2k7b | ||||||
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タイトル | NMR structure of Mg2+-bound CaBP1 N-domain | ||||||
![]() | Calcium-binding protein 1 | ||||||
![]() | METAL BINDING PROTEIN / EF-hand / calcium / CaBP1 / Alternative splicing / Cell membrane / Cytoplasm / Cytoskeleton / Lipoprotein / Membrane / Myristate | ||||||
機能・相同性 | ![]() response to stimulus / enzyme inhibitor activity / Sensory processing of sound by inner hair cells of the cochlea / nuclear localization sequence binding / negative regulation of protein import into nucleus / calcium channel regulator activity / visual perception / calcium-dependent protein binding / cell cortex / postsynaptic density ...response to stimulus / enzyme inhibitor activity / Sensory processing of sound by inner hair cells of the cochlea / nuclear localization sequence binding / negative regulation of protein import into nucleus / calcium channel regulator activity / visual perception / calcium-dependent protein binding / cell cortex / postsynaptic density / cytoskeleton / Golgi membrane / calcium ion binding / perinuclear region of cytoplasm / extracellular space / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Ames, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: NMR structure of Mg2+-bound CaBP1 N-domain 著者: Ames, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 363.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 298.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 482.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 606 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 30 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 53.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8957.129 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 76 to 151 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] CaBP1, 10 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.05 / pH: 7.4 / 圧: ambient / 温度: 300 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 / 詳細: xplor-NIH and YASAP protocol | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |