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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2k6t | ||||||
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タイトル | Solution structure of the relaxin-like factor | ||||||
要素 |
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キーワード | HORMONE / protein / Cleavage on pair of basic residues / Disease mutation / Polymorphism / Secreted | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Relaxin receptors / positive regulation of cAMP-mediated signaling / oocyte maturation / positive regulation of wound healing / positive regulation of epithelial cell migration / adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway / G protein-coupled receptor binding / insulin receptor binding / hormone activity / male gonad development ...Relaxin receptors / positive regulation of cAMP-mediated signaling / oocyte maturation / positive regulation of wound healing / positive regulation of epithelial cell migration / adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway / G protein-coupled receptor binding / insulin receptor binding / hormone activity / male gonad development / cell-cell signaling / spermatogenesis / G alpha (s) signalling events / protease binding / negative regulation of cell population proliferation / signaling receptor binding / positive regulation of cell population proliferation / negative regulation of apoptotic process / perinuclear region of cytoplasm / extracellular space / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics, simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Bullesbach, E.E. / Hass, M.A.S. / Jensen, M.R. / Hansen, D.F. / Kristensen, S.M. / Schwabe, C. / Led, J.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2008 タイトル: Solution structure of a conformationally restricted fully active derivative of the human relaxin-like factor 著者: Bullesbach, E.E. / Hass, M.A.S. / Jensen, M.R. / Hansen, D.F. / Kristensen, S.M. / Schwabe, C. / Led, J.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2k6t.cif.gz | 335 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2k6t.ent.gz | 289.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2k6t.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2k6t_validation.pdf.gz | 354.3 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2k6t_full_validation.pdf.gz | 607 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2k6t_validation.xml.gz | 26.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2k6t_validation.cif.gz | 41.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k6/2k6t ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k6/2k6t | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2778.189 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 106-131 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: This sequence occurs naturally in humans. / 参照: UniProt: P51460 |
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3528.118 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 25-55 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: This sequence occurs naturally in humans. / 参照: UniProt: P51460 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: structure was determined using homonuclear NOE |
-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics, simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 1154 / NOE intraresidue total count: 506 / NOE long range total count: 182 / NOE medium range total count: 208 / NOE sequential total count: 258 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / Maximum lower distance constraint violation: 0 Å / Maximum upper distance constraint violation: 6 Å / 代表コンフォーマー: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMR ensemble rms | Distance rms dev: 0.053 Å / Distance rms dev error: 0.0015 Å |