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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2k4x | ||||||
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タイトル | Solution structure of 30S ribosomal protein S27A from Thermoplasma acidophilum | ||||||
要素 | 30S ribosomal protein S27ae | ||||||
キーワード | RIBOSOMAL PROTEIN / 30S ribosomal protein S27A / Metal-binding / Ribonucleoprotein / Zinc-finger / Structural Genomics / PSI-2 / Protein Structure Initiative / Northeast Structural Genomics Consortium / NESG / Ontario Centre for Structural Proteomics / OCSP | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Thermoplasma acidophilum (好酸性) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Wu, B. / Yee, A. / Fares, C. / Lemak, A. / Semest, A. / Arrowsmith, C. / Montelione, G.T. / Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) / Ontario Centre for Structural Proteomics (OCSP) | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Solution structure of 30S ribosomal protein S27A from Thermoplasma acidophilum/Northeast Structural Genomics Consortium Target TaT88/Ontario Center for Structural Proteomics target ta1093 著者: Wu, B. / Yee, A. / Fares, C. / Lemak, A. / Semest, A. / Arrowsmith, C. #1: ジャーナル: J.Biomol.Nmr / 年: 2011 タイトル: A novel strategy for NMR resonance assignment and protein structure determination. 著者: Lemak, A. / Gutmanas, A. / Chitayat, S. / Karra, M. / Fares, C. / Sunnerhagen, M. / Arrowsmith, C.H. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2k4x.cif.gz | 358.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2k4x.ent.gz | 302.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2k4x.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2k4x_validation.pdf.gz | 534.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2k4x_full_validation.pdf.gz | 640.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2k4x_validation.xml.gz | 24.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2k4x_validation.cif.gz | 35.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k4/2k4x ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k4/2k4x | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6397.507 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Thermoplasma acidophilum (好酸性) / 生物種: acidophilum / 遺伝子: rps27ae, Ta1093 / プラスミド: p11 / 生物種 (発現宿主): coli / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q9HJ78 |
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#2: 化合物 | ChemComp-ZN / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 300 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |