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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2jp3 | ||||||
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タイトル | Solution Structure of the human FXYD4 (CHIF) protein in SDS micelles | ||||||
要素 | FXYD domain-containing ion transport regulator 4 | ||||||
キーワード | TRANSCRIPTION / Protein | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 inorganic cation transmembrane transport => GO:0098662 / Ion transport by P-type ATPases / regulation of sodium ion transmembrane transporter activity / sodium:potassium-exchanging ATPase complex / ion channel regulator activity / Ion homeostasis / potassium channel activity / sodium channel regulator activity / ATPase binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Rattus norvegicus (ドブネズミ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Franzin, C.M. / Teriete, P. / Marassi, F.M. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2007 タイトル: Structural similarity of a membrane protein in micelles and membranes 著者: Franzin, C.M. / Teriete, P. / Marassi, F.M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2jp3.cif.gz | 29.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2jp3.ent.gz | 19.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2jp3.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2jp3_validation.pdf.gz | 322.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2jp3_full_validation.pdf.gz | 326.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2jp3_validation.xml.gz | 3.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2jp3_validation.cif.gz | 3.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jp/2jp3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jp/2jp3 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7012.076 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Rattus norvegicus (ドブネズミ) / 遺伝子: Fxyd4 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): C41 (DE3) / 参照: UniProt: Q63113 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.52 / pH: 5 / 圧: ambient / 温度: 313.15 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |