登録情報 データベース : PDB / ID : 2ihn 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Co-crystal of Bacteriophage T4 RNase H with a fork DNA substrate 要素5'-D(*CP*TP*AP*AP*CP*TP*TP*TP*GP*AP*GP*GP*CP*AP*GP*AP*CP*C)-3'5'-D(*GP*GP*TP*CP*TP*GP*CP*CP*TP*CP*AP*AP*GP*AP*CP*GP*GP*TP*AP*GP*TP*CP*AP*A)-3'Ribonuclease H 詳細キーワード HYDROLASE/DNA / BPT4 RNase H / protein:DNA complex / 5'-3' exonuclease / Hydrolase (nucleic acid) / helix-hairpin-helix motif type 2 (HhH2) / fork DNA / HYDROLASE-DNA COMPLEX機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
DNA replication, Okazaki fragment processing / 5'-3' RNA exonuclease activity / 5'-flap endonuclease activity / DNA replication, removal of RNA primer / ribonuclease H / RNA-DNA hybrid ribonuclease activity / DNA binding 類似検索 - 分子機能 T4 RNase H, C-terminal / T4 RNase H, C terminal / Flap endonuclease / 5'-nuclease / 5'-3' exonuclease, alpha-helical arch, N-terminal / 5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain / 5'-3' exonuclease / 5'-3' exonuclease / Helix-hairpin-helix motif, class 2 / Helix-hairpin-helix class 2 (Pol1 family) motifs ... T4 RNase H, C-terminal / T4 RNase H, C terminal / Flap endonuclease / 5'-nuclease / 5'-3' exonuclease, alpha-helical arch, N-terminal / 5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain / 5'-3' exonuclease / 5'-3' exonuclease / Helix-hairpin-helix motif, class 2 / Helix-hairpin-helix class 2 (Pol1 family) motifs / 5'-3' exonuclease, C-terminal domain superfamily / PIN-like domain superfamily / 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain / DNA polymerase; domain 1 / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Enterobacteria phage T4 (ファージ)手法 X線回折 / 分子置換 / 解像度 : 3 Å 詳細データ登録者 Devos, J.M. / Mueser, T.C. 引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2007タイトル : Crystal structure of bacteriophage T4 5' nuclease in complex with a branched DNA reveals how FEN-1 family nucleases bind their substrates.著者 : Devos, J.M. / Tomanicek, S.J. / Jones, C.E. / Nossal, N.G. / Mueser, T.C. 履歴 登録 2006年9月26日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2007年8月21日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2021年10月20日 Group : Database references / カテゴリ : database_2 / struct_ref_seq_difItem : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details改定 1.3 2023年8月30日 Group : Data collection / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
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