ソフトウェア | 名称 | 分類 |
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SHELXL-97 | 精密化 | CNS | 精密化 | CrystalClear | データ収集 | d*TREK | データ削減 | d*TREK | データスケーリング | CNS | 位相決定 |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: DNA PART OF NDB ENTRY GDL009 OR PDB ENTRY 2DBE. 解像度: 1.63→8 Å / Num. parameters: 2379 / Num. restraintsaints: 2537 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
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Rfree | 0.313 | 799 | 9.76 % | RANDOM |
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all | 0.228 | 8184 | - | - |
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obs | 0.22 | - | 89 % | - |
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: MOEWS & KRETSINGER, J.MOL.BIOL.91(1973)201-228 |
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Refine analyze | Num. disordered residues: 0 / Occupancy sum hydrogen: 0 / Occupancy sum non hydrogen: 594 |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.63→8 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 0 | 486 | 33 | 75 | 594 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
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X-RAY DIFFRACTION | s_bond_d0.008 | X-RAY DIFFRACTION | s_angle_d0.028 | X-RAY DIFFRACTION | s_similar_dist0 | X-RAY DIFFRACTION | s_from_restr_planes0.015 | X-RAY DIFFRACTION | s_zero_chiral_vol0 | X-RAY DIFFRACTION | s_non_zero_chiral_vol0.007 | X-RAY DIFFRACTION | s_anti_bump_dis_restr0.009 | X-RAY DIFFRACTION | s_rigid_bond_adp_cmpnt0 | X-RAY DIFFRACTION | s_similar_adp_cmpnt0.063 | X-RAY DIFFRACTION | s_approx_iso_adps0 | | | | | | | | | | |
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