登録情報 データベース : PDB / ID : 2hvs 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structure of T4 RNA Ligase 2 with Nicked 5'-Adenylated nucleic acid duplex containing a 2'-deoxyribonucleotide at the nick 要素5'-D(*AP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*AP*GP*TP*GP*GP*GP*GP*TP*CP*GP*CP*AP*AP*TP*TP*G)-3'5'-D(*CP*AP*AP*TP*TP*GP*CP*GP*AP*C)-R(P*(OMC)P*C)-3'5'-D(P*CP*AP*CP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*T)-3'T4 RNA Ligase 2 詳細キーワード LIGASE/DNA/RNA / RNA / LIGASE / LYSINE ADENYLATE / T4 / PROTEIN DNA-RNA COMPLEX / LIGASE-DNA-RNA COMPLEX機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
RNA ligase (ATP) / RNA ligase (ATP) activity / RNA repair / ATP binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 RNA ligase / RNA ligase 2, C-terminal / RNA ligase 1/2, C-terminal domain superfamily / RNA ligase 2, viral / T4 RNA ligase 2 C-terminal / RNA ligase, Rnl2 / RNA ligase domain, REL/Rln2 / RNA ligase / Dna Ligase; domain 1 - #70 / DNA ligase/mRNA capping enzyme ... RNA ligase / RNA ligase 2, C-terminal / RNA ligase 1/2, C-terminal domain superfamily / RNA ligase 2, viral / T4 RNA ligase 2 C-terminal / RNA ligase, Rnl2 / RNA ligase domain, REL/Rln2 / RNA ligase / Dna Ligase; domain 1 - #70 / DNA ligase/mRNA capping enzyme / D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 1 / Dna Ligase; domain 1 / Arc Repressor Mutant, subunit A / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE MONOPHOSPHATE / DNA / DNA (> 10) / DNA/RNA hybrid / DNA/RNA hybrid (> 10) / RNA ligase 2 類似検索 - 構成要素生物種 Enterobacteria phage T4 (ファージ)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.5 Å 詳細データ登録者 Nandakumar, J. / Lima, C.D. 引用ジャーナル : Cell(Cambridge,Mass.) / 年 : 2006タイトル : RNA Ligase Structures Reveal the Basis for RNA Specificity and Conformational Changes that Drive Ligation Forward.著者 : Nandakumar, J. / Shuman, S. / Lima, C.D. 履歴 登録 2006年7月30日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2006年10月17日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2008年5月1日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2013年8月28日 Group : Non-polymer description改定 1.4 2017年10月18日 Group : Refinement description / カテゴリ : software改定 1.5 2023年8月30日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
すべて表示 表示を減らす Remark 999 SEQUENCE According to authors, glycine at position 112 is correct. This mutation likely represents ... SEQUENCE According to authors, glycine at position 112 is correct. This mutation likely represents a natural mutation in the 'population' of T4 phage