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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2hso | ||||||
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タイトル | Multipattern rietveld refinement with protein powder data: An approach to higher resolution | ||||||
要素 | Lysozyme C | ||||||
キーワード | HYDROLASE / Powder diffraction / Rietveld refinement / Lysozyme | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Lactose synthesis / Antimicrobial peptides / Neutrophil degranulation / beta-N-acetylglucosaminidase activity / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium ...Lactose synthesis / Antimicrobial peptides / Neutrophil degranulation / beta-N-acetylglucosaminidase activity / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / defense response to bacterium / endoplasmic reticulum / extracellular space / identical protein binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Gallus gallus (ニワトリ) | ||||||
手法 | 粉末回折 / シンクロトロン / 解像度: 1.98 Å | ||||||
データ登録者 | Von Dreele, R.B. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.APPL.CRYSTALLOGR. / 年: 2007 タイトル: Multipattern Rietveld refinement with protein powder data: an approach to higher resolution 著者: Von Dreele, R.B. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2hso.cif.gz | 29.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2hso.ent.gz | 21.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2hso.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hs/2hso ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hs/2hso | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14331.160 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Gallus gallus (ニワトリ) / 遺伝子: LYZ / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P00698, lysozyme |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 粉末回折 |
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-試料調製
結晶化 | 温度: 298 K / 手法: batch crystallization / pH: 4 詳細: Rapid precipitation from 1.25M NaCl in 0.05M KHPHTHALATE BUFFER, pH 4, batch crystallization, temperature 298K |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 298 K |
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放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 1-BM-C / 波長: 0.62074 Å |
検出器 | タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2004年6月14日 |
放射 | モノクロメーター: SI(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M |
放射波長 | 波長: 0.62074 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.98→17.77 Å / Num. all: 8747 / Num. obs: 8747 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 4.998 % / Biso Wilson estimate: 27.4 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.01 |
-解析
ソフトウェア |
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