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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ho9 | ||||||
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タイトル | Solution Structure of chemotaxi protein CheW from Escherichia coli | ||||||
要素 | Chemotaxis protein cheW | ||||||
キーワード | SIGNALING PROTEIN / chemotaxis protein CheW / Escherichia coli / solution structure | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 methyl accepting chemotaxis protein complex / positive regulation of post-translational protein modification / aerotaxis / cell tip / establishment of localization in cell / chemotaxis / protein domain specific binding / signal transduction / plasma membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing, molecular dynamics | ||||||
データ登録者 | Jin, C. / Li, Y. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Solution Structure of chemotaxi protein CheW from Escherichia coli 著者: Jin, C. / Li, Y. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2ho9.cif.gz | 1004.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2ho9.ent.gz | 848.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2ho9.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2ho9_validation.pdf.gz | 356 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2ho9_full_validation.pdf.gz | 469.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2ho9_validation.xml.gz | 58.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2ho9_validation.cif.gz | 78.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ho/2ho9 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ho/2ho9 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18095.693 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / プラスミド: pET21a / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A964 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 3D heteronuclear techniques |
-試料調製
詳細 | 内容: 1mM ArsC U-15N, 13C; 30mM Tris 30mM NaCl buffer; 90% H2O, 10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 60mM / pH: 7.3 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing, molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |