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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2hm3 | ||||||
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タイトル | Nematocyst outer wall antigen, cysteine rich domain NW1 | ||||||
![]() | Nematocyst outer wall antigen | ||||||
![]() | STRUCTURAL PROTEIN / disulfide / evolution / cysteine rich / nematocyst | ||||||
機能・相同性 | ![]() Golgi-associated plant pathogenesis-related protein 1, SCP domain / SCP / Tpx-1 / Ag5 / PR-1 / Sc7 family of extracellular domains. / CAP domain / Cysteine-rich secretory protein family / CAP superfamily / SEA domain / SEA domain / Lectin C-type domain / C-type lectin domain profile. / C-type lectin-like ...Golgi-associated plant pathogenesis-related protein 1, SCP domain / SCP / Tpx-1 / Ag5 / PR-1 / Sc7 family of extracellular domains. / CAP domain / Cysteine-rich secretory protein family / CAP superfamily / SEA domain / SEA domain / Lectin C-type domain / C-type lectin domain profile. / C-type lectin-like / C-type lectin (CTL) or carbohydrate-recognition domain (CRD) / C-type lectin-like/link domain superfamily / C-type lectin fold 類似検索 - ドメイン・相同性 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Meier, S. / Jensen, P.R. / Grzesiek, S. / Oezbek, S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Sequence-Structure and Structure-Function Analysis in Cysteine-rich Domains Forming the Ultrastable Nematocyst Wall. 著者: Meier, S. / Jensen, P.R. / Adamczyk, P. / Bachinger, H.P. / Holstein, T.W. / Engel, J. / Ozbek, S. / Grzesiek, S. #1: ![]() タイトル: Continuous molecular evolution of protein-domain structures by single amino Acid changes. 著者: Meier, S. / Jensen, P.R. / David, C.N. / Chapman, J. / Holstein, T.W. / Grzesiek, S. / Ozbek, S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 59.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 44.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 345.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 404.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3080.433 Da / 分子数: 1 / 断片: First cysteine rich domain / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 10 mM / pH: 5.5 / 圧: ambient / 温度: 288 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |