[English] 日本語
Yorodumi- PDB-2gv9: Crystal structure of the Herpes Simplex virus type 1 DNA polymerase -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 2gv9 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of the Herpes Simplex virus type 1 DNA polymerase | ||||||
Components | DNA polymerase | ||||||
Keywords | TRANSFERASE / Polymerase alpha fold | ||||||
Function / homology | Function and homology information viral DNA genome replication / ribonuclease H / RNA-DNA hybrid ribonuclease activity / DNA replication / DNA-directed DNA polymerase / DNA-directed DNA polymerase activity / nucleotide binding / host cell nucleus / DNA binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Human herpesvirus 1 (Herpes simplex virus type 1) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MAD / Resolution: 2.68 Å | ||||||
Authors | Liu, S. | ||||||
Citation | Journal: J.Biol.Chem. / Year: 2006 Title: Crystal structure of the herpes simplex virus 1 DNA polymerase. Authors: Liu, S. / Knafels, J.D. / Chang, J.S. / Waszak, G.A. / Baldwin, E.T. / Deibel, M.R. / Thomsen, D.R. / Homa, F.L. / Wells, P.A. / Tory, M.C. / Poorman, R.A. / Gao, H. / Qiu, X. / Seddon, A.P. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 2gv9.cif.gz | 412.5 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb2gv9.ent.gz | 324.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 2gv9.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gv/2gv9 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gv/2gv9 | HTTPS FTP |
---|
-Related structure data
Similar structure data |
---|
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Refine code: 4
|