登録情報 データベース : PDB / ID : 2gmu 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of E coli GDP-4-keto-6-deoxy-D-mannose-3-dehydratase complexed with PLP-glutamate ketimine intermediate 要素Putative pyridoxamine 5-phosphate-dependent dehydrase, WbdK 詳細 キーワード TRANSFERASE / colitose / deoxysugar / aspartate aminotransferase / PLP / o-antigen機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
dTDP-4-amino-4,6-dideoxygalactose transaminase activity / 転移酵素; 含窒素の基を移すもの; H2 N-アミノ基を移すもの / polysaccharide biosynthetic process / pyridoxal phosphate binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase / DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Alpha-Beta Complex ... DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase / DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Alpha-Beta Complex / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-PDG / : / Pyridoxamine 5-phosphate-dependent dehydrase 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli O55:H7 (大腸菌)手法 X線回折 / フーリエ合成 / 解像度 : 1.9 Å 詳細データ登録者 Cook, P.D. / Thoden, J.B. / Holden, H.M. 引用ジャーナル : Protein Sci. / 年 : 2006タイトル : The structure of GDP-4-keto-6-deoxy-D-mannose-3-dehydratase: a unique coenzyme B6-dependent enzyme.著者 : Cook, P.D. / Thoden, J.B. / Holden, H.M. 履歴 登録 2006年4月7日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2006年9月5日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2008年5月1日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2017年10月18日 Group : Refinement description / カテゴリ : software改定 1.4 2023年8月30日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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