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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2f4x | ||||||||||||||||||
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タイトル | NMR Solution of HIV-1 Lai Kissing Complex | ||||||||||||||||||
![]() | 5'-R(P*![]() RNA / SL1 / kissing complex / hairpin | 機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics, simulated annealing | ![]() Kieken, F. / Paquet, F. / Brule, F. / Paoletti, J. / Lancelot, G. | ![]() ![]() タイトル: A new NMR solution structure of the SL1 HIV-1Lai loop-loop dimer 著者: Kieken, F. / Paquet, F. / Brule, F. / Paoletti, J. / Lancelot, G. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 532.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 452.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 314.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 426.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 24.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 7762.693 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 詳細: RNA was prepared by in vitro transcription with T7 RNA polymerase |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics, simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations,structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 18 |