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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2f3j | ||||||
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タイトル | The solution structure of the REF2-I mRNA export factor (residues 1-155). | ||||||
![]() | RNA and export factor binding protein 2 | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / RRM domain / RBD domain. | ||||||
機能・相同性 | ![]() mRNA transport / mRNA export from nucleus / RNA splicing / spliceosomal complex / mRNA processing / single-stranded DNA binding / mRNA binding / RNA binding / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / ARIA protocol (Nilges et al., 1997, J. Mol. Biol. 269, 408-422) used for structure calculation. | ||||||
![]() | Golovanov, A.P. / Hautbergue, G.M. / Wilson, S.A. / Lian, L.Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The solution structure of REF2-I reveals interdomain interactions and regions involved in binding mRNA export factors and RNA. 著者: Golovanov, A.P. / Hautbergue, G.M. / Tintaru, A.M. / Lian, L.Y. / Wilson, S.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 758 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 642.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 350.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 497.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 48.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 63.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19630.188 Da / 分子数: 1 / 断片: RRM Domain (Residues 1 - 155) / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: The protein construct contains 14-residue N-terminal T7 tag (MASMTGGQQMGRDP), and C-terminal tag (LEHHHHHH). The T7 tag is unstructured and is omitted in the coordinate file, where residue ...Text: The protein construct contains 14-residue N-terminal T7 tag (MASMTGGQQMGRDP), and C-terminal tag (LEHHHHHH). The T7 tag is unstructured and is omitted in the coordinate file, where residue numbering starts from residue 1 of REF2-I. Last three residues (LEH) in the coordinate file originate from the beginning of C-terminal tag. The N-terminal domain (1-74) of REF2-I is flexible and is largely unstructured, apart from the region 8-18 which forms a transient helix. |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: ARIA protocol (Nilges et al., 1997, J. Mol. Biol. 269, 408-422) used for structure calculation. ソフトェア番号: 1 詳細: Residual dipolar couplings were measured in 5% PEG liquid crystal media (C12E5 + hexane, Ruckert and Otting, 2000, J. Am. Chem. Soc. 122, 7793) and used as SANI restraints in ARIA. | ||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 14 |