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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2eqq | ||||||
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タイトル | Solution structure of growth-blocking peptide of the armyworm, Pseudaletia separata | ||||||
要素 | Growth-blocking peptide, long form | ||||||
キーワード | CYTOKINE / GROWTH-BLOCKING PEPTIDE | ||||||
機能・相同性 | Paralytic/GBP/PSP peptide / Paralytic/GBP/PSP peptide / hemocyte migration / regulation of synaptic transmission, dopaminergic / positive regulation of cell division / cytokine activity / growth factor activity / extracellular space / Growth-blocking peptide, long form 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Mythimna separata (アワヨトウ) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Umetsu, Y. / Aizawa, T. / Kamiya, M. / Kumaki, Y. / Demura, M. / Kawano, K. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2009 タイトル: C-terminal elongation of growth-blocking peptide enhances its biological activity and micelle binding affinity 著者: Umetsu, Y. / Aizawa, T. / Muto, K. / Yamamoto, H. / Kamiya, M. / Kumaki, Y. / Mizuguchi, M. / Demura, M. / Hayakawa, Y. / Kawano, K. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2eqq.cif.gz | 186.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2eqq.ent.gz | 164.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2eqq.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2eqq_validation.pdf.gz | 335.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2eqq_full_validation.pdf.gz | 429.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2eqq_validation.xml.gz | 10.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2eqq_validation.cif.gz | 17.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/eq/2eqq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/eq/2eqq | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3115.542 Da / 分子数: 1 / 断片: Growth-blocking peptide, long form / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mythimna separata (アワヨトウ) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q27913 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 3mM 1-28GBP(pH4.4); 90% H2O, 10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 4.4 / 圧: ambient / 温度: 283 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |