登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ei9 |
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タイトル | Crystal structure of R1Bm endonuclease domain |
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要素 | Non-LTR retrotransposon R1Bmks ORF2 protein |
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キーワード | GENE REGULATION / four layered alpha beta sandwich |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
RNA-directed DNA polymerase / RNA-directed DNA polymerase activity類似検索 - 分子機能 Endonuclease-reverse transcriptase / Deoxyribonuclease I; Chain A / Endonuclease/exonuclease/phosphatase / Endonuclease/exonuclease/phosphatase / Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamily / Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) / Reverse transcriptase domain / Reverse transcriptase (RT) catalytic domain profile. / 4-Layer Sandwich / DNA/RNA polymerase superfamily / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ACETIC ACID / Non-LTR retrotransposon R1Bmks ORF2 protein / RNA-directed DNA polymerase homolog (R1)類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_arthropod.gif) Bombyx mori (カイコ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Maita, N. / Aoyagi, H. / Osanai, M. / Shirakawa, M. / Fujiwara, H. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2007 タイトル: Characterization of the sequence specificity of the R1Bm endonuclease domain by structural and biochemical studies. 著者: Maita, N. / Aoyagi, H. / Osanai, M. / Shirakawa, M. / Fujiwara, H. |
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履歴 | 登録 | 2007年3月12日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2007年7月17日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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