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Yorodumi- PDB-2e0z: Crystal structure of virus-like particle from Pyrococcus furiosus -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 2e0z | ||||||
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Title | Crystal structure of virus-like particle from Pyrococcus furiosus | ||||||
Components | Virus-like particle | ||||||
Keywords | VIRUS LIKE PARTICLE / virus-like particle / virus / bacteriophage / HK97 / T4 | ||||||
Function / homology | Function and homology information peptidase activity / oxidoreductase activity / defense response to bacterium / metal ion binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Pyrococcus furiosus (archaea) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MIR / Resolution: 3.6 Å | ||||||
Authors | Akita, F. / Chong, K.T. / Tanaka, H. / Yamashita, E. / Miyazaki, N. / Nakaishi, Y. / Namba, K. / Ono, Y. / Suzuki, M. / Tsukihara, T. / Nakagawa, A. | ||||||
Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2007 Title: The Crystal Structure of a Virus-like Particle from the Hyperthermophilic Archaeon Pyrococcus furiosus Provides Insight into the Evolution of Viruses Authors: Akita, F. / Chong, K.T. / Tanaka, H. / Yamashita, E. / Miyazaki, N. / Nakaishi, Y. / Suzuki, M. / Namba, K. / Ono, Y. / Tsukihara, T. / Nakagawa, A. | ||||||
History |
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Remark 295 | REMARK: THE SUPPLIED NCS OPERATORS AND THE IDENTITY MATRIX ARE SUFFICIENT TO GENERATE HALF OF THE ... REMARK: THE SUPPLIED NCS OPERATORS AND THE IDENTITY MATRIX ARE SUFFICIENT TO GENERATE HALF OF THE PARTICLE (30 COPIES OF THE BIOLOGICAL ASYMMETRIC UNIT). THE BIOLOGICAL ASYMMETRIC UNIT IS COMPOSED OF THREE CHAINS, A, B, and C. |
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 2e0z.cif.gz | 150.7 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb2e0z.ent.gz | 120.3 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 2e0z.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e0/2e0z ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e0/2e0z | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Similar structure data |
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-Links
-Assembly
Deposited unit |
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1 |
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
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3 |
| x 5|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 |
| x 6|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 |
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Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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