- PDB-2dk8: Solution structure of rpc34 subunit in RNA polymerase III from mouse -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 2dk8
タイトル
Solution structure of rpc34 subunit in RNA polymerase III from mouse
要素
DNA-directed RNA polymerase III 39 kDa polypeptide
キーワード
TRANSLATION / structural genomics / RNA_pol_Rpc34 domain / RNA polymerase III C39 subunit / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI
機能・相同性
機能・相同性情報
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter / positive regulation of innate immune response / transcription by RNA polymerase III / RNA polymerase III complex / positive regulation of interferon-beta production / DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity / double-stranded DNA binding / defense response to virus / innate immune response 類似検索 - 分子機能
タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 800 MHz
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解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
XwinNMR
2.6
Bruker
collection
NMRPipe
20031121
Delaglio,F.
解析
NMRView
5.0.4
Johnson,B.A.
データ解析
KUJIRA
0.9321
Kobayashi,N.
データ解析
CYANA
1.0.8
Guntert,P.
構造決定
CYANA
1.0.8
Guntert,P.
精密化
精密化
手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: target function, structures with the lowest energy, structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20