登録情報 | データベース: PDB / ID: 2die |
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タイトル | Alkaline alpha-amylase AmyK from Bacillus sp. KSM-1378 |
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要素 | amylase |
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キーワード | HYDROLASE / beta-alpha-barrels |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
alpha-amylase activity / carbohydrate metabolic process / calcium ion binding / extracellular space類似検索 - 分子機能 Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3 - #140 / Alpha-amylase, thermostable / Alpha-amylase C-terminal, prokaryotic / Alpha-amylase C-terminal / Alpha amylase, catalytic domain / Glycosyl hydrolase, family 13, catalytic domain / Alpha-amylase domain / Golgi alpha-mannosidase II / Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3 / Glycosyl hydrolase, all-beta ...Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3 - #140 / Alpha-amylase, thermostable / Alpha-amylase C-terminal, prokaryotic / Alpha-amylase C-terminal / Alpha amylase, catalytic domain / Glycosyl hydrolase, family 13, catalytic domain / Alpha-amylase domain / Golgi alpha-mannosidase II / Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3 / Glycosyl hydrolase, all-beta / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Immunoglobulin-like / Beta Barrel / Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Bacillus sp. (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
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データ登録者 | Shirai, T. / Igarashi, K. / Ozawa, T. / Hagihara, H. / Kobayashi, T. / Ozaki, K. / Ito, S. |
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引用 | ジャーナル: Proteins / 年: 2007 タイトル: Ancestral sequence evolutionary trace and crystal structure analyses of alkaline alpha-amylase from Bacillus sp. KSM-1378 to clarify the alkaline adaptation process of proteins 著者: Shirai, T. / Igarashi, K. / Ozawa, T. / Hagihara, H. / Kobayashi, T. / Ozaki, K. / Ito, S. |
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履歴 | 登録 | 2006年3月29日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2007年2月13日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月25日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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