登録情報 | データベース: PDB / ID: 2dcf |
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タイトル | Crystal structure of 6-aminohexanoate-dimer hydrolase S112A/G181D/H266N mutant with substrate |
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要素 | 6-aminohexanoate-dimer hydrolase |
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キーワード | HYDROLASE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
6-aminohexanoate-oligomer exohydrolase / 6-aminohexanoate-dimer hydrolase activity / nylon catabolic process類似検索 - 分子機能 Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #420 / Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 - #710 / : / Beta-lactamase-related / Beta-lactamase / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Beta-lactamase / DD-peptidase/beta-lactamase superfamily / Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 / Helix non-globular ...Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #420 / Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 - #710 / : / Beta-lactamase-related / Beta-lactamase / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Beta-lactamase / DD-peptidase/beta-lactamase superfamily / Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 / Helix non-globular / Beta-lactamase/transpeptidase-like / Special / Up-down Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 6-AMINOHEXANOIC ACID / 6-aminohexanoate-dimer hydrolase / 6-aminohexanoate-dimer hydrolase / 6-aminohexanoate-dimer hydrolase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Flavobacterium sp. (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 1.4 Å |
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データ登録者 | Ohki, T. / Shibata, N. / Higuchi, Y. / Takeo, M. / Negoro, S. |
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引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2007 タイトル: Nylon-oligomer degrading enzyme/substrate complex: catalytic mechanism of 6-aminohexanoate-dimer hydrolase 著者: Negoro, S. / Ohki, T. / Shibata, N. / Sasa, K. / Hayashi, H. / Nakano, H. / Yasuhira, K. / Kato, D. / Takeo, M. / Higuchi, Y. |
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履歴 | 登録 | 2006年1月6日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2007年1月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年8月23日 | Group: Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen |
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改定 1.4 | 2021年11月10日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / struct_conn ...database_2 / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.5 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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改定 2.0 | 2023年11月15日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom ...atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id |
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