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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2csu | ||||||
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タイトル | Crystal structure of PH0766 from Pyrococcus horikoshii OT3 | ||||||
![]() | 457aa long hypothetical protein | ||||||
![]() | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / Pyrococcus horikoshii / PH0766 / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Sugahara, M. / Kunishima, N. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of PH0766 from Pyrococcus horikoshii OT3 著者: Sugahara, M. / Kunishima, N. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 181.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 151.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 443.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 470.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 39.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 57.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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詳細 | The biological assembly is a dimer (chain A and B) in the asymmetric unit. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 50493.039 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.3 Å3/Da / 溶媒含有率: 45 % |
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結晶化 | 温度: 295 K / 手法: マイクロバッチ法 / pH: 4.7 / 詳細: PEG4000, pH 4.7, microbatch, temperature 295K |
-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 |
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反射 | 解像度: 2.2→20 Å / Num. all: 45198 / Num. obs: 45198 / % possible obs: 99.9 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 7.6 % / Biso Wilson estimate: 37.383 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.109 / Rsym value: 0.101 / Net I/σ(I): 8 | ||||||||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 2.2→2.28 Å / 冗長度: 6.7 % / Rmerge(I) obs: 0.575 / Mean I/σ(I) obs: 2.91 / Num. unique all: 4486 / Rsym value: 0.529 / % possible all: 99.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 44.3 Å2
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Refine analyze |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→19.85 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.2→2.28 Å / Rfactor Rfree error: 0.023
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