- PDB-2bv9: HOW FAMILY 26 GLYCOSIDE HYDROLASES ORCHESTRATE CATALYSIS ON DIFFE... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 2bv9
タイトル
HOW FAMILY 26 GLYCOSIDE HYDROLASES ORCHESTRATE CATALYSIS ON DIFFERENT POLYSACCHARIDES. STRUCTURE AND ACTIVITY OF A CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM LICHENASE, CtLIC26A
HOW FAMILY 26 GLYCOSIDE HYDROLASES ORCHESTRATE CATALYSIS ON DIFFERENT POLYSACCHARIDES. STRUCTURE ...HOW FAMILY 26 GLYCOSIDE HYDROLASES ORCHESTRATE CATALYSIS ON DIFFERENT POLYSACCHARIDES. STRUCTURE AND ACTIVITY OF A CLOSTRIDIUM THERMOCELLUM LICHENASE, CTLIC26A RESIDUES 1-3 (MAS) OF THE GIVEN SEQUENCE ARE DERIVED FROM THE CLONING VECTOR PET 21A AND ARE 282-290 (LEHHHHHH).
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実験情報
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実験
実験
手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 2
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試料調製
結晶
マシュー密度: 2.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 48 %
結晶化
詳細: 0.3-1.2M NA FORMATE, 0.1M NA CACODYLATE BUFFERED AT PH 6.5 AND 5-20% PEG 4K
モノクロメーター: GE(220) CRYSTAL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.934 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.5→36 Å / Num. obs: 51705 / % possible obs: 96.3 % / 冗長度: 5.4 % / Rmerge(I) obs: 0.05 / Net I/σ(I): 7.5
反射 シェル
解像度: 1.5→1.58 Å / 冗長度: 5.3 % / Rmerge(I) obs: 0.1 / Mean I/σ(I) obs: 14.5 / % possible all: 96.3
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.2.0005
精密化
MOSFLM
データ削減
SCALA
データスケーリング
SHELXD
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.5→36.51 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.974 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.966 / SU B: 0.853 / SU ML: 0.033 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.057 / ESU R Free: 0.059 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.157
2547
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.131
-
-
-
obs
0.132
47084
96 %
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溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK