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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2atr | ||||||
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タイトル | Acetyltransferase, GNAT family protein SP0256 from Streptococcus pneumoniae TIGR4 | ||||||
![]() | acetyltransferase, GNAT family | ||||||
![]() | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / MCSG / Streptococcus pneumoniae / acetyltransferase / GNAT family / PSI / Protein Structure Initiative / Midwest Center for Structural Genomics | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Binkowski, T.A. / Hatzos, C. / Abdullah, J. / Collart, F. / Joachimiak, A. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Acetyltransferase, GNAT family protein SP0256 from Streptococcus pneumoniae 著者: Binkowski, T.A. / Hatzos, C. / Abdullah, J. / Collart, F. / Joachimiak, A. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 36.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 28.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 425 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 426.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 10.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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2 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15876.375 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: TIGR4 / 遺伝子: SP0256 / プラスミド: PET15b / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.79 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.84 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 1.0M (NH4)2HPO4, 0.1M Tris pH 8.5, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 150 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: SBC-1 / 検出器: CCD / 日付: 2005年6月14日 |
放射 | モノクロメーター: Double Crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9792348 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.01→61.78 Å / Num. all: 11450 / Num. obs: 10898 / % possible obs: 95.5 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 |
反射 シェル | 解像度: 2.01→2.08 Å / % possible all: 91.6 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 37.694 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.01→61.78 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.01→2.063 Å / Total num. of bins used: 20
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