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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2at2 | ||||||
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タイトル | MOLECULAR STRUCTURE OF BACILLUS SUBTILIS ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 3.0 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() aspartate carbamoyltransferase / aspartate carbamoyltransferase activity / amino acid metabolic process / amino acid binding / 'de novo' UMP biosynthetic process / 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Stevens, R.C. / Reinisch, K.M. / Lipscomb, W.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Molecular structure of Bacillus subtilis aspartate transcarbamoylase at 3.0 A resolution. 著者: Stevens, R.C. / Reinisch, K.M. / Lipscomb, W.N. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 36.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 20.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 316.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 316.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 722 B | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper:
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詳細 | THE TRANSFORMATION PRESENTED ON *MTRIX 1* RECORDS BELOW WILL YIELD APPROXIMATE COORDINATES FOR CHAIN *B* WHEN APPLIED TO CHAIN *A*. THE TRANSFORMATION PRESENTED ON *MTRIX 2* RECORDS BELOW WILL YIELD APPROXIMATE COORDINATES FOR CHAIN *C* WHEN APPLIED TO CHAIN *A*. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 33775.129 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 5.03 Å3/Da / 溶媒含有率: 75.52 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 21 ℃ / pH: 8.5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 3 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. obs: 30228 / % possible obs: 83 % / Num. measured all: 154232 / Rmerge(I) obs: 0.09 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.19 / Rfactor obs: 0.19 / 最高解像度: 3 Å 詳細: BECAUSE OF THE LOW RESOLUTION OF THE STUDY, ONLY CA ATOMS ARE LISTED. RESIDUES 69 - 84, 179 - 191, AND 212 - 229 ARE LOOP REGIONS IN POOR ELECTRON DENSITY AS DISCUSSED IN THE ARTICLE LISTED ...詳細: BECAUSE OF THE LOW RESOLUTION OF THE STUDY, ONLY CA ATOMS ARE LISTED. RESIDUES 69 - 84, 179 - 191, AND 212 - 229 ARE LOOP REGIONS IN POOR ELECTRON DENSITY AS DISCUSSED IN THE ARTICLE LISTED ABOVE. THE GEOMETRY OF THESE RESIDUES WERE FIT TO THE SCARCE ELECTRON DENSITY AND ARE NOT NECESSARILY IN OPTIMUM ORIENTATIONS. RESIDUES 296 - 304 ARE NOT LISTED BECAUSE OF A LACK OF ELECTRON DENSITY. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 3 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 3 Å / 最低解像度: 7 Å / Num. reflection obs: 28662 / σ(I): 4 / Rfactor obs: 0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 4.6 |