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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2alp | |||||||||
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タイトル | REFINED STRUCTURE OF ALPHA-LYTIC PROTEASE AT 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION. ANALYSIS OF HYDROGEN BONDING AND SOLVENT STRUCTURE | |||||||||
![]() | ALPHA-LYTIC PROTEASE | |||||||||
![]() | HYDROLASE (SERINE PROTEINASE) | |||||||||
機能・相同性 | ![]() alpha-lytic endopeptidase / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Fujinaga, M. / Delbaere, L.T.J. / Brayer, G.D. / James, M.N.G. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Refined structure of alpha-lytic protease at 1.7 A resolution. Analysis of hydrogen bonding and solvent structure. 著者: Fujinaga, M. / Delbaere, L.T. / Brayer, G.D. / James, M.N. #1: ![]() タイトル: Molecular Structure of the Alpha-Lytic Protease from Myxobacter 495 at 2.8 Angstroms Resolution 著者: Brayer, G.D. / Delbaere, L.T.J. / James, M.N.G. #2: ![]() タイトル: Comparison of the Predicted Model of Alph-Lytic Protease with the X-Ray Structure 著者: Delbaere, L.T.J. / Brayer, G.D. / James, M.N.G. #3: ![]() タイトル: Amino Acid Sequence Alignment of Bacterial and Mammalian Pancreatic Serine Proteases Based on Topological Equivalences 著者: James, M.N.G. / Delbaere, L.T.J. / Brayer, G.D. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 50.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 35.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUE 95 IS A CIS-PROLINE. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19875.131 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P00778, alpha-lytic endopeptidase | ||
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#2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.55 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.7 % | ||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6.1 / 手法: microdialysis / 詳細: Brayer, G.D., (1979) J.Mol.Biol., 131, 743. | ||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS |
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解析
精密化 | 解像度: 1.7→8 Å / Rfactor Rwork: 0.131 / σ(I): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→8 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS Num. reflection obs: 14996 / σ(I): 2 / 最高解像度: 1.7 Å / 最低解像度: 8 Å / Rfactor obs: 0.131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 14.3 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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