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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 254d | ||||||||||||||||||
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タイトル | ALTERNATING AND NON-ALTERNATING DG-DC HEXANUCLEOTIDES CRYSTALLIZE AS CANONICAL A-DNA | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / A-DNA / DOUBLE HELIX / MODIFIED | 機能・相同性 | DNA | ![]() 手法 | ![]() ![]() Mooers, B.H. / Schroth, G.P. / Baxter, W.W. / Ho, P.S. | ![]() ![]() タイトル: Alternating and non-alternating dG-dC hexanucleotides crystallize as canonical A-DNA. 著者: Mooers, B.H. / Schroth, G.P. / Baxter, W.W. / Ho, P.S. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 15.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 10.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 357.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 359.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 3.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 1838.259 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.48 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.37 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 / 詳細: pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP / Temp details: ROOM TEMPERATURE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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結晶化 | *PLUS pH: 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 298 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1992年1月1日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→32 Å / Num. all: 2937 / Num. obs: 2937 / % possible obs: 68.3 % / Observed criterion σ(I): 2 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / 最低解像度: 32 Å / % possible obs: 68.3 % / Observed criterion σ(I): 2 |
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解析
ソフトウェア | 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.9→8 Å / σ(F): 2
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原子変位パラメータ | Biso mean: 20.2 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine Biso |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→8 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / 最低解像度: 8 Å / σ(F): 2 / Rfactor obs: 0.176 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 20.2 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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