登録情報 | データベース: PDB / ID: 1zbl |
---|
タイトル | Bacillus halodurans RNase H catalytic domain mutant D192N in complex with 12-mer RNA/DNA hybrid |
---|
要素 | - 5'-D(*GP*AP*AP*TP*CP*AP*GP*GP*TP*GP*TP*C)-3'
- 5'-R(*GP*AP*CP*AP*CP*CP*UP*GP*AP*UP*UP*C)-3'
- ribonuclease H-related protein
|
---|
キーワード | HYDROLASE/RNA/DNA / RNase H / RNA/DNA hybrid / DDE motif / HYDROLASE-RNA-DNA COMPLEX |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
ribonuclease H / RNA-DNA hybrid ribonuclease activity / nucleic acid binding / metal ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Ribonuclease H, Bacteroides-type / Ribonuclease H1, N-terminal / Ribonuclease H1, N-terminal domain superfamily / Caulimovirus viroplasmin / Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribonuclease H domain / RNase H type-1 domain profile. / Nucleotidyltransferase; domain 5 / Ribonuclease H superfamily ...Ribonuclease H, Bacteroides-type / Ribonuclease H1, N-terminal / Ribonuclease H1, N-terminal domain superfamily / Caulimovirus viroplasmin / Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribonuclease H domain / RNase H type-1 domain profile. / Nucleotidyltransferase; domain 5 / Ribonuclease H superfamily / Ribonuclease H-like superfamily / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 : / DNA / DNA (> 10) / RNA / RNA (> 10) / Ribonuclease H類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | Bacillus halodurans (バクテリア) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.2 Å |
---|
データ登録者 | Nowotny, M. / Gaidamakov, S.A. / Crouch, R.J. / Yang, W. |
---|
引用 | ジャーナル: Cell(Cambridge,Mass.) / 年: 2005 タイトル: Crystal Structures of RNase H Bound to an RNA/DNA Hybrid: Substrate Specificity and Metal-Dependent Catalysis. 著者: Nowotny, M. / Gaidamakov, S.A. / Crouch, R.J. / Yang, W. |
---|
履歴 | 登録 | 2005年4月8日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2005年7月12日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Source and taxonomy / Version format compliance |
---|
改定 1.3 | 2021年10月20日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / pdbx_struct_conn_angle ...database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
改定 1.4 | 2023年8月23日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
---|
|
---|