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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1yfc | ||||||
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タイトル | Solution nmr structure of a yeast iso-1-ferrocytochrome C | ||||||
![]() | YEAST ISO-1-FERROCYTOCHROME C | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT / FERROCYTOCHROME / MITOCHONDRION / RESPIRATORY CHAIN / METHYLATION | ||||||
機能・相同性 | ![]() Release of apoptotic factors from the mitochondria / Pyroptosis / Respiratory electron transport / Detoxification of Reactive Oxygen Species / cardiolipin binding / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / : / mitochondrial intermembrane space / electron transfer activity ...Release of apoptotic factors from the mitochondria / Pyroptosis / Respiratory electron transport / Detoxification of Reactive Oxygen Species / cardiolipin binding / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / : / mitochondrial intermembrane space / electron transfer activity / heme binding / mitochondrion / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry | ||||||
![]() | Baistrocchi, P. / Banci, L. / Bertini, I. / Turano, P. / Bren, K.L. / Gray, H.B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Three-dimensional solution structure of Saccharomyces cerevisiae reduced iso-1-cytochrome c. 著者: Baistrocchi, P. / Banci, L. / Bertini, I. / Turano, P. / Bren, K.L. / Gray, H.B. #1: ![]() タイトル: Assignment of Proton Resonances, Identification of Secondary Structural Elements, and Analysis of Backbone Chemical Shifts for the C102T Variant of Yeast Iso-1-Cytochrome C and Horse Cytochrome C 著者: Gao, Y. / Boyd, J. / Williams, R.J. / Pielak, G.J. #2: ![]() タイトル: High-Resolution Refinement of Yeast Iso-1-Cytochrome C and Comparisons with Other Eukaryotic Cytochromes C 著者: Louie, G.V. / Brayer, G.D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 695.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 597.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12099.850 Da / 分子数: 1 / 変異: C102S / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: REDUCED FORM 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: YEAST ISO-1-CYTOCHROME C / Variant: C102S / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-HEC / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
試料状態 | pH: 7 / 温度: 303 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX 600 / 製造業者: Bruker / モデル: AMX 600 / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry / ソフトェア番号: 1 | ||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: TARGET FUNCTION <= 0.82 A2 / 計算したコンフォーマーの数: 500 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |