登録情報 データベース : PDB / ID : 1xjm 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structural mechanism of allosteric substrate specificity in a ribonucleotide reductase: dTTP complex 要素ribonucleotide reductase, B12-dependent 詳細 キーワード OXIDOREDUCTASE / ribonucleotide reductase / 10 alpha-beta barrel / allosteric regulation / substrate specificity / protein-nucleotide complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
cobalamin binding / ribonucleoside-diphosphate reductase / ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor / deoxyribonucleotide biosynthetic process / DNA biosynthetic process / ATP binding 類似検索 - 分子機能 TSCPD domain / TSCPD domain / Ribonucleotide reductase, adenosylcobalamin-dependent / : / Anaerobic Ribonucleotide-triphosphate Reductase Large Chain / Anaerobic Ribonucleotide-triphosphate Reductase Large Chain - #20 / Ribonucleotide reductase R1 subunit, N-terminal / Ribonucleotide reductase large subunit, N-terminal / Ribonucleotide reductase, all-alpha domain / Ribonucleotide reductase large subunit, C-terminal ... TSCPD domain / TSCPD domain / Ribonucleotide reductase, adenosylcobalamin-dependent / : / Anaerobic Ribonucleotide-triphosphate Reductase Large Chain / Anaerobic Ribonucleotide-triphosphate Reductase Large Chain - #20 / Ribonucleotide reductase R1 subunit, N-terminal / Ribonucleotide reductase large subunit, N-terminal / Ribonucleotide reductase, all-alpha domain / Ribonucleotide reductase large subunit, C-terminal / Ribonucleotide reductase, barrel domain / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE / Vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase 類似検索 - 構成要素生物種 Thermotoga maritima (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.4 Å 詳細データ登録者 Larsson, K.-M. / Jordan, A. / Eliasson, R. / Reichard, P. / Logan, D.T. / Nordlund, P. 引用ジャーナル : Nat.Struct.Mol.Biol. / 年 : 2004タイトル : Structural mechanism of allosteric substrate specificity regulation in a ribonucleotide reductase.著者 : Larsson, K.-M. / Jordan, A. / Eliasson, R. / Reichard, P. / Logan, D.T. / Nordlund, P. 履歴 登録 2004年9月23日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2005年12月20日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2008年4月30日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2017年10月11日 Group : Refinement description / カテゴリ : software / Item : _software.classification / _software.name改定 1.4 2023年8月23日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / diffrn_source / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ncs_dom_lim / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
すべて表示 表示を減らす Remark 999 SEQUENCE Residue 205 is a tyrosine in GB NP_227934 but no density for atoms beyond CB can be found ... SEQUENCE Residue 205 is a tyrosine in GB NP_227934 but no density for atoms beyond CB can be found in an otherwise ordered loop, suggesting sequencing error or spontaneous mutation. The authors suggest a point mutation either in the sequencing clone (SER->TYR mutation) or in their expression clone (TYR->SER). Codons for TYR=ATA and SER=AGA.