- PDB-1x5w: Solution structure of the C2H2 type zinc-binding domain of human ... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 1x5w
タイトル
Solution structure of the C2H2 type zinc-binding domain of human zinc finger protein 64, isoforms 1 and 2
要素
Zinc finger protein 64, isoforms 1
キーワード
TRANSCRIPTION / Zinc finger protein 338 / ZNF338 / Nuclear protein / DNA binding / C2H2 type zinc finger / Structural genomics / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI
機能・相同性
機能・相同性情報
megasporocyte nucleus / mesenchymal cell differentiation / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / DNA binding / nucleus / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能
タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 700 MHz
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解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
XwinNMR
3.5
Bruker
collection
NMRPipe
20031121
Delaglio, F.
解析
NMRView
5.0.4
Johnson, B. A.
データ解析
KUJIRA
0.921
Kobayashi, N.
データ解析
CYANA
2.0.17
Guntert, P.
構造決定
CYANA
2.0.17
Guntert, P.
精密化
精密化
手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: target function, structures with the lowest energy, structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20