登録情報 | データベース: PDB / ID: 1wyd |
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タイトル | Crystal Structure of Aspartyl-tRNA synthetase from Sulfolobus tokodaii |
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要素 | hypothetical aspartyl-tRNA synthetase |
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キーワード | LIGASE / aspartyl-tRNA synthetase / archaea / sulfolobus tokodaii |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
aspartate-tRNAAsn ligase / aspartate-tRNA(Asn) ligase activity / aspartyl-tRNA aminoacylation / aspartate-tRNA ligase activity / nucleic acid binding / magnesium ion binding / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Aspartate-tRNA synthetase, type 2 / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. ...Aspartate-tRNA synthetase, type 2 / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Nucleic acid-binding proteins / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Nucleic acid-binding, OB-fold / Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Sulfolobus tokodaii (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.3 Å |
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データ登録者 | Maeda, Y. / Hossain, M.T. / Ubukata, S. / Suzuki, K. / Sekiguchi, T. / Takenaka, A. |
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引用 | ジャーナル: ACTA CRYSTALLOGR.,SECT.D / 年: 2007 タイトル: Structure of the nondiscriminating aspartyl-tRNA synthetase from the crenarchaeon Sulfolobus tokodaii strain 7 reveals the recognition mechanism for two different tRNA anticodons 著者: Sato, Y. / Maeda, Y. / Shimizu, S. / Hossain, M.T. / Ubukata, S. / Suzuki, K. / Sekiguchi, T. / Takenaka, A. |
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履歴 | 登録 | 2005年2月12日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2006年7月4日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2007年9月14日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Derived calculations / Source and taxonomy / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2024年3月13日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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