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Yorodumi- PDB-1vqr: Crystal structure of a virulence factor (cj0248) from campylobact... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1vqr | ||||||
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Title | Crystal structure of a virulence factor (cj0248) from campylobacter jejuni subsp. jejuni at 2.25 A resolution | ||||||
Components | hypothetical protein Cj0248Hypothesis | ||||||
Keywords | UNKNOWN FUNCTION / Hd-domain/pdease-like fold / structural genomics / Joint Center for Structural Genomics / JCSG / Protein Structure Initiative / PSI | ||||||
Function / homology | Metal-dependent hydrolase HDOD / HDOD domain / HD-related output (HDOD) domain profile. / Hypothetical protein af1432 / Hypothetical protein af1432 / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / HDOD domain-containing protein / : Function and homology information | ||||||
Biological species | Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 (Campylobacter) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / SAD / Resolution: 2.25 Å | ||||||
Authors | Joint Center for Structural Genomics (JCSG) | ||||||
Citation | Journal: Proteins / Year: 2006 Title: Crystal structure of virulence factor CJ0248 from Campylobacter jejuni at 2.25 A resolution reveals a new fold. Authors: Xu, Q. / Schwarzenbacher, R. / McMullan, D. / Abdubek, P. / Agarwalla, S. / Ambing, E. / Axelrod, H. / Biorac, T. / Canaves, J.M. / Chiu, H.J. / Deacon, A.M. / DiDonato, M. / Elsliger, M.A. ...Authors: Xu, Q. / Schwarzenbacher, R. / McMullan, D. / Abdubek, P. / Agarwalla, S. / Ambing, E. / Axelrod, H. / Biorac, T. / Canaves, J.M. / Chiu, H.J. / Deacon, A.M. / DiDonato, M. / Elsliger, M.A. / Godzik, A. / Grittini, C. / Grzechnik, S.K. / Hale, J. / Hampton, E. / Han, G.W. / Haugen, J. / Hornsby, M. / Jaroszewski, L. / Klock, H.E. / Koesema, E. / Kreusch, A. / Kuhn, P. / Lesley, S.A. / Miller, M.D. / Moy, K. / Nigoghossian, E. / Paulsen, J. / Quijano, K. / Reyes, R. / Rife, C. / Spraggon, G. / Stevens, R.C. / van den Bedem, H. / Velasquez, J. / White, A. / Wolf, G. / Hodgson, K.O. / Wooley, J. / Wilson, I.A. | ||||||
History |
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Remark 300 | BIOMOLECULE: 1, 2, 3, 4 THIS ENTRY CONTAINS THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT WHICH CONSISTS OF ... BIOMOLECULE: 1, 2, 3, 4 THIS ENTRY CONTAINS THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT WHICH CONSISTS OF 4 CHAIN(S). SEE REMARK 350 FOR INFORMATION ON GENERATING THE BIOLOGICAL MOLECULE(S). SIZE EXCLUSION CHROMATOGRAPHY (SEC) AND MULTI-ANGLE LIGHT SCATTERING (MALS) SUPPORT THE ASSIGNMENT OF THE BIOLOGICAL OLIGOMERIZATION STATE AS A MONOMER. |
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1vqr.cif.gz | 219 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb1vqr.ent.gz | 179.2 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1vqr.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vq/1vqr ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vq/1vqr | HTTPS FTP |
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-Related structure data
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-Links
-Assembly
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Ens-ID: 1
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