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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1vnd | ||||||
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タイトル | VND/NK-2 PROTEIN (HOMEODOMAIN), NMR | ||||||
要素 | VND/NK-2 PROTEIN | ||||||
キーワード | DNA BINDING PROTEIN / DNA-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 neuroblast development / neuroblast fate determination / glial cell development / brain development / DNA-binding transcription factor binding / cell differentiation / DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / negative regulation of gene expression / regulation of transcription by RNA polymerase II ...neuroblast development / neuroblast fate determination / glial cell development / brain development / DNA-binding transcription factor binding / cell differentiation / DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / negative regulation of gene expression / regulation of transcription by RNA polymerase II / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Tsao, D.H.H. / Gruschus, J.M. / Wang, L.-H. / Nirenberg, M. / Ferretti, J.A. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1995 タイトル: The three-dimensional solution structure of the NK-2 homeodomain from Drosophila. 著者: Tsao, D.H. / Gruschus, J.M. / Wang, L.H. / Nirenberg, M. / Ferretti, J.A. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1994 タイトル: Elongation of Helix III of the Nk-2 Homeodomain Upon Binding to DNA: A Secondary Structure Study by NMR 著者: Tsao, D.H. / Gruschus, J.M. / Wang, L.H. / Nirenberg, M. / Ferretti, J.A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1vnd.cif.gz | 874.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1vnd.ent.gz | 747 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1vnd.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vn/1vnd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vn/1vnd | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9374.741 Da / 分子数: 1 / 断片: HOMEODOMAIN / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ) 器官: FRUIT / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P22808 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
試料状態 | pH: 4.4 / 温度: 285 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-解析
ソフトウェア |
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NMR software | 名称: X-PLOR / 開発者: BRUNGER / 分類: 精密化 | ||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 30 |