登録情報 | データベース: PDB / ID: 1v74 |
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タイトル | Structure of the E. coli colicin D bound to its immunity protein ImmD |
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要素 | - Colicin D
- Colicin D immunity protein
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キーワード | ANTIBIOTIC/IMMUNE SYSTEM / colicin D - ImmD complex / cytotoxicity / transfer RNase / protein-protein inhibition / ANTIBIOTIC-IMMUNE SYSTEM COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
extrachromosomal circular DNA / bacteriocin immunity / toxic substance binding / RNA nuclease activity / killing of cells of another organism / defense response to bacterium類似検索 - 分子機能 Colicin D / Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, - #200 / Colicin D immunity protein domain / Colicin D superfamily / Bacterial self-protective colicin-like immunity / Colicin D, C-terminal / Colicin D, C-terminal domain superfamily / Colicin D / Colicin D/E5 nuclease domain superfamily / S-type Pyocin ...Colicin D / Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, - #200 / Colicin D immunity protein domain / Colicin D superfamily / Bacterial self-protective colicin-like immunity / Colicin D, C-terminal / Colicin D, C-terminal domain superfamily / Colicin D / Colicin D/E5 nuclease domain superfamily / S-type Pyocin / Cloacin colicin family / Colicin-like bacteriocin tRNase domain / Pyosin/cloacin translocation domain / Pyosin/cloacin translocation domain superfamily / Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, / Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) / Roll / Up-down Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Graille, M. / Mora, L. / Buckingham, R.H. / van Tilbeurgh, H. / de Zamaroczy, M. |
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引用 | ジャーナル: Embo J. / 年: 2004 タイトル: Structural inhibition of the colicin D tRNase by the tRNA-mimicking immunity protein 著者: Graille, M. / Mora, L. / Buckingham, R.H. / Van Tilbeurgh, H. / De Zamaroczy, M. |
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履歴 | 登録 | 2003年12月10日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2004年3月30日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月27日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2018年1月3日 | Group: Structure summary / カテゴリ: struct / Item: _struct.title |
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改定 1.4 | 2023年12月27日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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