ONLY THE CATALYTIC DOMAIN HAS BEEN CLONED CORRESPONDING TO RESIDUES 88 TO 380.
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実験情報
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実験
実験
手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1
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試料調製
結晶
マシュー密度: 2.03 Å3/Da / 溶媒含有率: 38.81 %
結晶化
pH: 4.6 詳細: 12 % PEG 4K, 12 % PEG 4K, 100 MM SODIUM ACTETATE PH 4.6, 200 MM LISO4. THE PROTEIN WAS AT 10MG/ML AND INCUBATED WITH 1 MM OF GLUCOSE-ISOFAGOMINE FOR 1 HOUR PRIOR CRYSTALLISATION. 30% PEG 400 ...詳細: 12 % PEG 4K, 12 % PEG 4K, 100 MM SODIUM ACTETATE PH 4.6, 200 MM LISO4. THE PROTEIN WAS AT 10MG/ML AND INCUBATED WITH 1 MM OF GLUCOSE-ISOFAGOMINE FOR 1 HOUR PRIOR CRYSTALLISATION. 30% PEG 400 ADDED AS CRYOPROTECTANT
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.9→20 Å / Num. obs: 21248 / % possible obs: 97.8 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.8 % / Rmerge(I) obs: 0.071 / Net I/σ(I): 14.6
反射 シェル
解像度: 1.9→1.97 Å / 冗長度: 2.9 % / Rmerge(I) obs: 0.206 / Mean I/σ(I) obs: 4.9 / % possible all: 95.1
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.1.24
精密化
DENZO
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: COMPLEX WITH SDP5 解像度: 1.9→19.8 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.966 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.945 / SU B: 2.54 / SU ML: 0.076 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.135 / ESU R Free: 0.125 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.177
1079
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.132
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-
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obs
0.134
20168
97.8 %
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溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK