登録情報 | データベース: PDB / ID: 1t6p |
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タイトル | Crystal Structure of Phenylalanine Ammonia Lyase from Rhodosporidium toruloides |
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要素 | phenylalanine ammonia-lyase |
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キーワード | LYASE / triple helix coiled coil / MIO / cinnamate |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
phenylalanine/tyrosine ammonia-lyase / tyrosine ammonia-lyase activity / cinnamic acid biosynthetic process / phenylalanine ammonia-lyase activity / L-phenylalanine catabolic process / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Phenylalanine ammonia-lyase 1; domain 3 / Phenylalanine ammonia-lyase / Phenylalanine ammonia-lyase, shielding domain superfamily / Phenylalanine/histidine ammonia-lyases, active site / Phenylalanine and histidine ammonia-lyases signature. / Aromatic amino acid lyase / Aromatic amino acid lyase / Enzyme I; Chain A, domain 2 / Fumarase/aspartase (N-terminal domain) / Fumarase/aspartase (Central domain) ...Phenylalanine ammonia-lyase 1; domain 3 / Phenylalanine ammonia-lyase / Phenylalanine ammonia-lyase, shielding domain superfamily / Phenylalanine/histidine ammonia-lyases, active site / Phenylalanine and histidine ammonia-lyases signature. / Aromatic amino acid lyase / Aromatic amino acid lyase / Enzyme I; Chain A, domain 2 / Fumarase/aspartase (N-terminal domain) / Fumarase/aspartase (Central domain) / Fumarase C; Chain A, domain 2 / Fumarase C; Chain B, domain 1 / Fumarase/histidase, N-terminal / L-Aspartase-like / Up-down Bundle / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Rhodosporidium toruloides (菌類) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.7 Å |
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データ登録者 | Calabrese, J.C. / Jordan, D.B. |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2004 タイトル: Crystal structure of phenylalanine ammonia lyase: multiple helix dipoles implicated in catalysis. 著者: Calabrese, J.C. / Jordan, D.B. / Boodhoo, A. / Sariaslani, S. / Vannelli, T. |
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履歴 | 登録 | 2004年5月6日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2004年10月12日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年10月11日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.4 | 2023年8月23日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details |
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改定 2.0 | 2023年11月15日 | Group: Atomic model / Data collection カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom ...atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_validate_main_chain_plane / pdbx_validate_peptide_omega / pdbx_validate_rmsd_angle / pdbx_validate_torsion Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 / _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 / _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 / _pdbx_validate_peptide_omega.omega |
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