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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1std | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF SCYTALONE DEHYDRATASE: A DISEASE DETERMINANT OF THE RICE PATHOGEN, MAGNAPORTHE GRISEA | ||||||
![]() | SCYTALONE DEHYDRATASE | ||||||
![]() | LYASE (CARBON-OXYGEN) | ||||||
機能・相同性 | ![]() scytalone dehydratase / scytalone dehydratase activity / melanin biosynthetic process / endosome / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Lundqvist, T. / Lindqvist, Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of scytalone dehydratase--a disease determinant of the rice pathogen, Magnaporthe grisea. 著者: Lundqvist, T. / Rice, J. / Hodge, C.N. / Basarab, G.S. / Pierce, J. / Lindqvist, Y. #1: ![]() タイトル: Preliminary Crystallographic Studies on Scytalone Dehydratase from Magnaporthe Grisea 著者: Lundqvist, T. / Weber, P.C. / Hodge, C.N. / Braswell, E.H. / Rice, J. / Pierce, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 44.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 31.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 20280.902 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-BFS / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.99 Å3/Da / 溶媒含有率: 58.91 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Lundqvist, T., (1993) J.Mol.Biol., 232, 999. | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.9 Å / Num. obs: 5646 / % possible obs: 99.5 % / Num. measured all: 41844 / Rmerge(I) obs: 0.085 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.179 / Rfactor obs: 0.179 / 最高解像度: 2.9 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.9 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 6 Å / Rfactor obs: 0.191 / Rfactor Rwork: 0.191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |